MultiVar : Statistiques Multivariées

Cours du Master en Bio-Informatique et Biostatistiques de la Faculté des Sciences de l’Université Paris-Saclay.

• Élève : Gustavo Magaña López

Ce répertoire contient les documents liés aux Travaux Pratiques du cours “Biostatistiques : Statistiques Multivariées”. Le développement initial sera fait en français, la langue d’enseignement de l’UE. Je veux éventuellement tout traduire en anglais, pour permettre à la communauté non-francophone de profiter de la référence pratique en R que ce répertoire peut apporter.

Travaux

1. Prise en main (TP1)

2. Données simulées (TP2)

3. Tests sur les modèles (TP3)

Reproducibilité

• La plate-forme de développement pour le langage R est par excellence RStudio. Pour reprendre le projet avec la même configuration que j’ai utilisée pour le développer, ouvrez le fichier .Rproj. RStudio devra alors ouvrir une session avec les paramètres que j’ai fixés.

• Une bonne pratique en Python est l’emploi d’environnements virtuels afin d’isoler les dependencies d’un projet de l’installation du système. En R, ceci est possible grâce à renv. Je vous invite à lire leur documentation et commencer à l’utiliser pour tous vos projets R. Je vous conseille fortement de lire la documentation de renv. C’est le seul moyen que j’ai de vous garantir que vous pourrez reproduire mes résultats. Sans ceci, la réussite de reproduction des résultats est une variable aléatoire qui suit la loi de Bernoulli avec une probabilité de réussite ridiculement faible.

• Une fois créé l’environnement spécifié par le fichier renv.lock, activez-le pour éditer ou exécuter n’importe quel rapport .Rmd ou script .R sans problèmes liés au paquets R.